Az Európai Unió működéséről szóló szerződés előírja, hogy a Számvevőszék és a tagállamok nemzeti ellenőrző szervei függetlenségük megőrzése mellett a bizalom szellemében együttműködjenek. Az uniós tagállamok legfőbb ellenőrző intézményei és a Számvevőszék közötti együttműködés kezdete a Számvevőszék 1977-ben történő létrehozásáig vezethető vissza, és az évek során egyre szorosabbá vált.